手数料型と保証料型の違いは、銀行に手数料を払うか保証会社に手数料を払うかです。保証会社へ手数料を払う保証料型は、途中繰上げ返済をした場合に未経過分が返金されます。一方、銀行へ手数料を払う手数料型は、返金されることはありませんが、長い返済期間の場合ですと支払総額が抑えられます。
このため、借り入れ当初から繰り上げ返済の予定がある方は保証料型、ひとまず借りて今後の状況次第という方は手数料型にしておきましょう。
どちらがいいか決めかねている方は、ご自身のライフプランを踏まえた返済計画を立ててみると決断しやすくなります。銀行やWEBサイトの意見だけでなく、実際にシミュレーションをして考えてみることをおすすめします。